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RG/D. Federal
Segunda-feira, 21-Ago-2000

Software desenvolvido pela Embrapa ajuda pesquisa do genoma

 

       21 de Agosto de 2000 - Um SOFTWARE DESENVOLVIDO PELA Empresa Brasileira de PESQUISA Agropecuária (EMBRAPA) poderá agilizar as pesquisas do Projeto GENOMA. O Sting Millenium é uma nova versão do Sting Suite, já utilizado por pesquisadores de 16 países. Em três anos, foi acessado por mais de cinco milhões de pessoas.

       Para que o projeto
GENOMA se torne útil à humanidade é preciso não só organizar os genes, mas identificar a função biológica de cada um deles. É isso que o Sting faz. A partir de uma seqüência, ele apresenta para que serve o gene em questão. Atualmente, os pesquisadores do GENOMA estão seqüenciando os genes. Será preciso ainda estruturá-los e descobrir suas funções. Essas duas etapas podem ser realizadas com o Sting.

       O SOFTWARE, com 15 programas, tem todos os passos para o pesquisador chegar até a informação sobre a funcionalidade do gene. No entanto, os programas não estudam todo o GENOMA, apenas as seqüências, pois o SOFTWARE ainda é semi-automático. Mas a previsão do idealizador do Sting, Goran Neshich, do Laboratório de Bioinformática da EMBRAPA, é que em seis meses haverá uma segunda versão, ainda mais ágil. 'Será possível o processamento em massa, identificando a função de diversos genes', explica.

       Neshich diz que os programas de análise fornecem visualização, simultânea e em três dimensões, de informações sobre estruturas macromoleculares de proteínas e suas seqüências, coloridas por tipo ou propriedade bioquímica. Além disso, mostra seqüências similares de proteínas, sua possível função, e também oferece um banco de dados com todas as informações sobre proteínas. Segundo ele, é o mais completo do mundo, pois atualmente os programas utilizados pelos pesquisadores fazem apenas uma dessas etapas.

      Atualmente, de acordo com Neshich, o SOFTWARE é utilizado mais em outros países do que no Brasil. Os programas podem ter funcionalidade tanto para o projeto GENOMA Humano, quanto do Câncer, bovino ou de plantas. 'Não importa o objetivo da PESQUISA, o SOFTWARE pode ser usado por qualquer um que queira identificar as funções das proteínas', diz.

       O pesquisador afirma que com o uso da ferramenta, algumas análises que demorariam até um mês para serem feitas podem ser concluídas em 10 minutos. O projeto tem colaboração da Universidade Columbia, de Nova Iorque (Estados Unidos). A primeira etapa do projeto foi desenvolvida lá e a segunda no Brasil. Os pesquisadores podem acessá-lo no site desta universidade, no da EMBRAPA e na rede Protein Data Bank (PDB), que está disponível em 16 países. Como é de praxe no âmbito acadêmico, os softwares podem ser usados livremente e sem custos pelos analistas, que os adaptam de acordo com suas necessidades. Apesar disso, quem quiser instalar os programas em computador próprio ou na rede de empresas comerciais paga pelo serviço.

       Neila Baldi de Brasília