Complet list of 1vdb con file
Complete list of 1vdb.con file
COMMENT BEGIN
#########################################################################
COMMENT END
CONTACTS BETWEEN
CHAIN(S) "A"
AND
CHAIN(S) "A"
HYDROPHOBIC 2.00 3.80 72
C A 0001 GLU C 2.434 C A 0002 THR CA
C A 0001 GLU C 3.547 C A 0002 THR C
C A 0001 GLU C 3.414 C A 0002 THR CB
C A 0001 GLU C 3.400 C A 0002 THR CG2
C A 0002 THR C 2.435 H A 0003 SER CA
C A 0002 THR C 3.202 H A 0003 SER C
C A 0002 THR C 3.671 H A 0003 SER CB
C A 0002 THR C 3.708 H A 0005 GLU CG
H A 0003 SER C 2.435 H A 0004 GLU CA
H A 0003 SER C 2.986 H A 0004 GLU C
H A 0003 SER C 3.716 H A 0004 GLU CB
H A 0004 GLU C 2.434 H A 0005 GLU CA
H A 0004 GLU C 3.075 H A 0005 GLU C
H A 0004 GLU C 3.706 H A 0005 GLU CB
H A 0005 GLU C 2.435 H A 0006 ARG CA
H A 0005 GLU C 3.084 H A 0006 ARG C
H A 0005 GLU C 3.707 H A 0006 ARG CB
H A 0006 ARG C 2.434 H A 0007 ALA CA
H A 0006 ARG C 3.075 H A 0007 ALA C
H A 0006 ARG C 3.698 H A 0007 ALA CB
H A 0006 ARG C 3.772 H A 0010 LEU CD1
H A 0007 ALA C 2.434 H A 0008 ALA CA
H A 0007 ALA C 2.990 H A 0008 ALA C
H A 0007 ALA C 3.706 H A 0008 ALA CB
H A 0007 ALA CA 3.442 H A 0010 LEU CD1
H A 0007 ALA C 3.749 H A 0010 LEU CD1
H A 0008 ALA C 2.435 H A 0009 ARG CA
H A 0008 ALA C 3.056 H A 0009 ARG C
H A 0008 ALA C 3.712 H A 0009 ARG CB
H A 0009 ARG C 2.434 H A 0010 LEU CA
H A 0009 ARG C 3.048 H A 0010 LEU C
H A 0009 ARG C 3.711 H A 0010 LEU CB
H A 0010 LEU C 2.432 H A 0011 ALA CA
H A 0010 LEU C 3.209 H A 0011 ALA C
H A 0010 LEU C 3.656 H A 0011 ALA CB
H A 0011 ALA C 2.433 H A 0012 LYS CA
H A 0011 ALA C 3.136 H A 0012 LYS C
H A 0011 ALA C 3.690 H A 0012 LYS CB
H A 0012 LYS C 2.434 H A 0013 MET CA
H A 0012 LYS C 3.077 H A 0013 MET C
H A 0012 LYS C 3.705 H A 0013 MET CB
H A 0013 MET C 2.434 H A 0014 SER CA
H A 0013 MET C 3.121 H A 0014 SER C
H A 0013 MET C 3.697 H A 0014 SER CB
H A 0014 SER C 2.433 H A 0015 ALA CA
H A 0014 SER C 3.123 H A 0015 ALA C
H A 0014 SER C 3.686 H A 0015 ALA CB
H A 0015 ALA C 2.435 H A 0016 TYR CA
H A 0015 ALA C 3.110 H A 0016 TYR C
H A 0015 ALA C 3.700 H A 0016 TYR CB
H A 0016 TYR C 2.434 H A 0017 ALA CA
H A 0016 TYR C 3.139 H A 0017 ALA C
H A 0016 TYR C 3.684 H A 0017 ALA CB
H A 0017 ALA C 2.434 H A 0018 ALA CA
H A 0017 ALA C 3.029 H A 0018 ALA C
H A 0017 ALA C 3.704 H A 0018 ALA CB
H A 0017 ALA C 3.470 H A 0021 LEU CD1
H A 0018 ALA C 2.434 H A 0019 GLN CA
H A 0018 ALA C 3.133 H A 0019 GLN C
H A 0018 ALA C 3.692 H A 0019 GLN CB
H A 0019 GLN C 2.434 H A 0020 ARG CA
H A 0019 GLN C 3.183 H A 0020 ARG C
H A 0019 GLN C 3.677 H A 0020 ARG CB
H A 0020 ARG C 2.433 H A 0021 LEU CA
H A 0020 ARG C 3.024 H A 0021 LEU C
H A 0020 ARG C 3.713 H A 0021 LEU CB
H A 0021 LEU C 2.434 H A 0022 ALA CA
H A 0021 LEU C 3.001 H A 0022 ALA C
H A 0021 LEU C 3.707 H A 0022 ALA CB
H A 0022 ALA C 2.435 C A 0023 ASN CA
H A 0022 ALA C 3.095 C A 0023 ASN C
H A 0022 ALA C 3.703 C A 0023 ASN CB
CHARGE_ATTR 2.00 12.00 19
C A 0001 GLU OE1 11.88 H A 0006 ARG NH1
C A 0001 GLU OE2 11.42 H A 0006 ARG NH1
C A 0001 GLU OE1 11.92 H A 0009 ARG NH1
C A 0001 GLU OE1 10.95 H A 0009 ARG NH2
C A 0001 GLU OE2 10.81 H A 0009 ARG NH1
C A 0001 GLU OE2 9.905 H A 0009 ARG NH2
H A 0004 GLU OE1 9.318 H A 0006 ARG NH1
H A 0004 GLU OE1 11.57 H A 0006 ARG NH2
H A 0004 GLU OE2 11.34 H A 0006 ARG NH1
H A 0005 GLU OE1 8.593 H A 0006 ARG NH1
H A 0005 GLU OE1 9.858 H A 0006 ARG NH2
H A 0005 GLU OE2 8.493 H A 0006 ARG NH1
H A 0005 GLU OE2 9.797 H A 0006 ARG NH2
H A 0005 GLU OE1 7.753 H A 0009 ARG NH1
H A 0005 GLU OE1 7.625 H A 0009 ARG NH2
H A 0005 GLU OE2 9.310 H A 0009 ARG NH1
H A 0005 GLU OE2 9.098 H A 0009 ARG NH2
H A 0005 GLU OE1 9.337 H A 0012 LYS NZ
H A 0005 GLU OE2 11.42 H A 0012 LYS NZ
CHARGE_REPU 2.00 12.00 14
C A 0001 GLU OE1 6.248 H A 0005 GLU OE1
C A 0001 GLU OE1 4.654 H A 0005 GLU OE2
C A 0001 GLU OE2 4.456 H A 0005 GLU OE1
C A 0001 GLU OE2 3.265 H A 0005 GLU OE2
H A 0004 GLU OE1 10.68 H A 0005 GLU OE1
H A 0004 GLU OE1 10.63 H A 0005 GLU OE2
H A 0004 GLU OE2 11.48 H A 0005 GLU OE1
H A 0004 GLU OE2 11.54 H A 0005 GLU OE2
H A 0006 ARG NH1 9.386 H A 0009 ARG NH1
H A 0006 ARG NH1 10.84 H A 0009 ARG NH2
H A 0006 ARG NH2 9.121 H A 0009 ARG NH1
H A 0006 ARG NH2 10.60 H A 0009 ARG NH2
H A 0009 ARG NH1 9.804 H A 0012 LYS NZ
H A 0009 ARG NH2 10.35 H A 0012 LYS NZ
HB_MM 2.00 3.20 33
C A 0002 THR N 2.249 C A 0001 GLU O
H A 0003 SER N 2.250 C A 0002 THR O
H A 0004 GLU N 2.250 H A 0003 SER O
H A 0005 GLU N 3.186 H A 0003 SER O
H A 0005 GLU N 2.250 H A 0004 GLU O
H A 0006 ARG N 2.911 H A 0003 SER O
H A 0006 ARG N 2.250 H A 0005 GLU O
H A 0007 ALA N 2.250 H A 0006 ARG O
H A 0008 ALA N 2.249 H A 0007 ALA O
H A 0009 ARG N 3.020 H A 0007 ALA O
H A 0009 ARG N 2.250 H A 0008 ALA O
H A 0010 LEU N 3.117 H A 0007 ALA O
H A 0010 LEU N 2.251 H A 0009 ARG O
H A 0011 ALA N 2.250 H A 0010 LEU O
H A 0012 LYS N 2.590 H A 0008 ALA O
H A 0012 LYS N 2.250 H A 0011 ALA O
H A 0013 MET N 2.867 H A 0009 ARG O
H A 0013 MET N 2.250 H A 0012 LYS O
H A 0014 SER N 2.250 H A 0013 MET O
H A 0015 ALA N 2.992 H A 0011 ALA O
H A 0015 ALA N 2.251 H A 0014 SER O
H A 0016 TYR N 3.023 H A 0012 LYS O
H A 0016 TYR N 2.250 H A 0015 ALA O
H A 0017 ALA N 2.250 H A 0016 TYR O
H A 0018 ALA N 3.112 H A 0014 SER O
H A 0018 ALA N 2.250 H A 0017 ALA O
H A 0019 GLN N 2.250 H A 0018 ALA O
H A 0020 ARG N 3.185 H A 0016 TYR O
H A 0020 ARG N 2.251 H A 0019 GLN O
H A 0021 LEU N 2.607 H A 0017 ALA O
H A 0021 LEU N 2.251 H A 0020 ARG O
H A 0022 ALA N 2.251 H A 0021 LEU O
C A 0023 ASN N 2.251 H A 0022 ALA O
HB_MS 2.00 3.20 1
H A 0003 SER N 3.196 C A 0002 THR OG1
AROMATIC 0.00 8.00 1
H A 0020 ARG 6.220 H A 0016 TYR